本章概述

本章分为四个部分， 我们从“宏观到微观到宏观”， 从“静态到动态再到静态”， 系统认识单细胞组学的分析方法， 其中：

单细胞数据分析的新⽅法与应⽤， 主要解决“是什么”的问题， 处理静态细胞的身份识别， 建立对细胞类型构成的整体认识。

单细胞轨迹分析新⽅法， 主要解决“怎么变化”的问题， 引入时间维度， 关注细胞状态转换。通过追踪单个细胞的命运决定， 揭示细胞发育和分化的动态过程。

单细胞动态过程与调控⽹络分析， 主要解决“为什么变化”的问题， 深入分子调控机制， 揭示变化的原因。 我们深入到基因调控网络层面，解析决定细胞命运的分子基础。

空间转录组与多模态数据整合， 主要解决“哪里变化的问题”， 添加了空间的维度， 并且整合了多层面信息。这一部分将细胞重新放回其所处的组织环境中，通过整合多维数据重建组织结构。